Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms