Protein–RNA interactions for Protein: Q07968

F13b, Coagulation factor XIII B chain, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13bQ07968 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
F13bQ07968 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
F13bQ07968 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
F13bQ07968 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
F13bQ07968 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
F13bQ07968 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
F13bQ07968 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
F13bQ07968 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
F13bQ07968 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
F13bQ07968 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
F13bQ07968 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
F13bQ07968 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
F13bQ07968 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
F13bQ07968 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
F13bQ07968 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
F13bQ07968 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
F13bQ07968 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
F13bQ07968 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
F13bQ07968 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
F13bQ07968 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
F13bQ07968 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
F13bQ07968 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
F13bQ07968 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
F13bQ07968 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
F13bQ07968 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
F13bQ07968 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
F13bQ07968 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
F13bQ07968 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
F13bQ07968 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
F13bQ07968 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
F13bQ07968 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
F13bQ07968 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
F13bQ07968 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
F13bQ07968 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
F13bQ07968 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
F13bQ07968 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
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F13bQ07968 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
F13bQ07968 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
F13bQ07968 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
F13bQ07968 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
F13bQ07968 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
F13bQ07968 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
F13bQ07968 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
F13bQ07968 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
F13bQ07968 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
F13bQ07968 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
F13bQ07968 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
F13bQ07968 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
F13bQ07968 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
F13bQ07968 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
F13bQ07968 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
F13bQ07968 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
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F13bQ07968 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
F13bQ07968 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
F13bQ07968 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
F13bQ07968 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
F13bQ07968 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
F13bQ07968 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
F13bQ07968 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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F13bQ07968 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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F13bQ07968 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
F13bQ07968 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
F13bQ07968 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
F13bQ07968 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
F13bQ07968 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
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F13bQ07968 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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F13bQ07968 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
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F13bQ07968 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
F13bQ07968 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
F13bQ07968 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
F13bQ07968 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
F13bQ07968 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
F13bQ07968 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
F13bQ07968 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
F13bQ07968 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
F13bQ07968 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
F13bQ07968 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
F13bQ07968 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
F13bQ07968 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
F13bQ07968 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
F13bQ07968 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
F13bQ07968 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
F13bQ07968 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
F13bQ07968 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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