Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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NfiaQ02780 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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NfiaQ02780 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
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NfiaQ02780 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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NfiaQ02780 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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NfiaQ02780 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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NfiaQ02780 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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NfiaQ02780 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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NfiaQ02780 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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