Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.5 ms