Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.66□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC8.66□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC8.66□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC8.66□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms