Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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