Protein–RNA interactions for Protein: P83510

Tnik, Traf2 and NCK-interacting protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnikP83510 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TnikP83510 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TnikP83510 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TnikP83510 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TnikP83510 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TnikP83510 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TnikP83510 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TnikP83510 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TnikP83510 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TnikP83510 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TnikP83510 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TnikP83510 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TnikP83510 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TnikP83510 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TnikP83510 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TnikP83510 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TnikP83510 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TnikP83510 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TnikP83510 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TnikP83510 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TnikP83510 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TnikP83510 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TnikP83510 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TnikP83510 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TnikP83510 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TnikP83510 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TnikP83510 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TnikP83510 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TnikP83510 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TnikP83510 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TnikP83510 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TnikP83510 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TnikP83510 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TnikP83510 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TnikP83510 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TnikP83510 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TnikP83510 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TnikP83510 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TnikP83510 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TnikP83510 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TnikP83510 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TnikP83510 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TnikP83510 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TnikP83510 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TnikP83510 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TnikP83510 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TnikP83510 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TnikP83510 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TnikP83510 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TnikP83510 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TnikP83510 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TnikP83510 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TnikP83510 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TnikP83510 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TnikP83510 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TnikP83510 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TnikP83510 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TnikP83510 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TnikP83510 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TnikP83510 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TnikP83510 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TnikP83510 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TnikP83510 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TnikP83510 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TnikP83510 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TnikP83510 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TnikP83510 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TnikP83510 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TnikP83510 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TnikP83510 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TnikP83510 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TnikP83510 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TnikP83510 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TnikP83510 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TnikP83510 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TnikP83510 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TnikP83510 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TnikP83510 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TnikP83510 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TnikP83510 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TnikP83510 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TnikP83510 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TnikP83510 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TnikP83510 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TnikP83510 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TnikP83510 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TnikP83510 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TnikP83510 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TnikP83510 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TnikP83510 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TnikP83510 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TnikP83510 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TnikP83510 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TnikP83510 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TnikP83510 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TnikP83510 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TnikP83510 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TnikP83510 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TnikP83510 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TnikP83510 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms