Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Otx2P80206 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Otx2P80206 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Otx2P80206 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Otx2P80206 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Otx2P80206 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Otx2P80206 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Otx2P80206 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Otx2P80206 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Otx2P80206 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms