Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

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Length 355 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Otx1P80205 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Otx1P80205 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Otx1P80205 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Otx1P80205 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Otx1P80205 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Otx1P80205 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Otx1P80205 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
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Otx1P80205 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Otx1P80205 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Otx1P80205 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Otx1P80205 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Otx1P80205 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Otx1P80205 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
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Otx1P80205 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Otx1P80205 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Otx1P80205 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Otx1P80205 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
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