Protein–RNA interactions for Protein: P63072

Ubd, Ubiquitin D, mousemouse

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Length 162 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbdP63072 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
UbdP63072 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
UbdP63072 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
UbdP63072 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
UbdP63072 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
UbdP63072 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
UbdP63072 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
UbdP63072 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
UbdP63072 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
UbdP63072 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
UbdP63072 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
UbdP63072 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
UbdP63072 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
UbdP63072 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
UbdP63072 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
UbdP63072 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
UbdP63072 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
UbdP63072 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
UbdP63072 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
UbdP63072 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
UbdP63072 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
UbdP63072 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
UbdP63072 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
UbdP63072 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
UbdP63072 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
UbdP63072 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
UbdP63072 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
UbdP63072 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
UbdP63072 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
UbdP63072 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
UbdP63072 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
UbdP63072 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
UbdP63072 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
UbdP63072 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
UbdP63072 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
UbdP63072 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
UbdP63072 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
UbdP63072 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
UbdP63072 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
UbdP63072 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
UbdP63072 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
UbdP63072 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
UbdP63072 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
UbdP63072 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
UbdP63072 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
UbdP63072 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
UbdP63072 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
UbdP63072 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
UbdP63072 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
UbdP63072 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
UbdP63072 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
UbdP63072 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
UbdP63072 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
UbdP63072 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
UbdP63072 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
UbdP63072 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
UbdP63072 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
UbdP63072 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
UbdP63072 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
UbdP63072 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
UbdP63072 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
UbdP63072 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
UbdP63072 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
UbdP63072 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
UbdP63072 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
UbdP63072 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
UbdP63072 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
UbdP63072 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
UbdP63072 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
UbdP63072 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
UbdP63072 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
UbdP63072 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
UbdP63072 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
UbdP63072 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
UbdP63072 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
UbdP63072 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
UbdP63072 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
UbdP63072 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
UbdP63072 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
UbdP63072 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
UbdP63072 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
UbdP63072 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
UbdP63072 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
UbdP63072 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
UbdP63072 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
UbdP63072 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
UbdP63072 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
UbdP63072 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
UbdP63072 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
UbdP63072 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
UbdP63072 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
UbdP63072 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
UbdP63072 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
UbdP63072 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
UbdP63072 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
UbdP63072 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
UbdP63072 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
UbdP63072 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
UbdP63072 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
UbdP63072 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
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