Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Cldn18P56857 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Cldn18P56857 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Cldn18P56857 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Cldn18P56857 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
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Cldn18P56857 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
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Cldn18P56857 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
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