Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

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Length 1,268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NcanP55066 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NcanP55066 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NcanP55066 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
NcanP55066 Gm15569-201ENSMUST00000133675 594 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NcanP55066 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NcanP55066 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NcanP55066 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NcanP55066 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NcanP55066 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NcanP55066 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
NcanP55066 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NcanP55066 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NcanP55066 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NcanP55066 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NcanP55066 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NcanP55066 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NcanP55066 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NcanP55066 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NcanP55066 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NcanP55066 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NcanP55066 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NcanP55066 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NcanP55066 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
NcanP55066 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
NcanP55066 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
NcanP55066 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
NcanP55066 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
NcanP55066 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
NcanP55066 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NcanP55066 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NcanP55066 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NcanP55066 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NcanP55066 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NcanP55066 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
NcanP55066 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NcanP55066 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NcanP55066 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NcanP55066 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NcanP55066 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NcanP55066 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NcanP55066 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NcanP55066 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NcanP55066 Art5-202ENSMUST00000106934 843 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NcanP55066 Tprkb-204ENSMUST00000113752 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NcanP55066 Gm11619-201ENSMUST00000117474 237 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
NcanP55066 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
NcanP55066 Gm14213-201ENSMUST00000119778 768 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
NcanP55066 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
NcanP55066 Gm11205-201ENSMUST00000137738 431 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NcanP55066 Aamdc-207ENSMUST00000138060 467 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NcanP55066 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NcanP55066 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NcanP55066 1700006J14Rik-204ENSMUST00000161511 574 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NcanP55066 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
NcanP55066 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
NcanP55066 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
NcanP55066 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NcanP55066 Gm7719-201ENSMUST00000182374 975 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
NcanP55066 Nmbr-206ENSMUST00000190114 662 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NcanP55066 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NcanP55066 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
NcanP55066 Gm39397-201ENSMUST00000212331 228 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NcanP55066 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
NcanP55066 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NcanP55066 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NcanP55066 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NcanP55066 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NcanP55066 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NcanP55066 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NcanP55066 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NcanP55066 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NcanP55066 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NcanP55066 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NcanP55066 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NcanP55066 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NcanP55066 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NcanP55066 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NcanP55066 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NcanP55066 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NcanP55066 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NcanP55066 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NcanP55066 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NcanP55066 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NcanP55066 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NcanP55066 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NcanP55066 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NcanP55066 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NcanP55066 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NcanP55066 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NcanP55066 Gm11578-201ENSMUST00000118530 459 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
NcanP55066 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NcanP55066 Gm3250-201ENSMUST00000167358 693 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NcanP55066 Gm3238-201ENSMUST00000168298 693 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NcanP55066 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NcanP55066 Gm18801-201ENSMUST00000186616 536 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
NcanP55066 Gm18123-201ENSMUST00000210874 822 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
NcanP55066 AC170997.1-201ENSMUST00000214554 1053 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NcanP55066 Mcpt4-201ENSMUST00000043249 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NcanP55066 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms