Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Hoxc13P50207 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Hoxc13P50207 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
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Hoxc13P50207 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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