Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tnfsf9P41274 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tnfsf9P41274 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Tnfsf9P41274 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tnfsf9P41274 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tnfsf9P41274 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tnfsf9P41274 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tnfsf9P41274 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tnfsf9P41274 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Tnfsf9P41274 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tnfsf9P41274 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tnfsf9P41274 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tnfsf9P41274 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tnfsf9P41274 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tnfsf9P41274 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tnfsf9P41274 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Tnfsf9P41274 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tnfsf9P41274 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tnfsf9P41274 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tnfsf9P41274 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tnfsf9P41274 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tnfsf9P41274 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tnfsf9P41274 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tnfsf9P41274 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tnfsf9P41274 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tnfsf9P41274 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tnfsf9P41274 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tnfsf9P41274 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tnfsf9P41274 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tnfsf9P41274 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tnfsf9P41274 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tnfsf9P41274 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tnfsf9P41274 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tnfsf9P41274 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tnfsf9P41274 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tnfsf9P41274 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tnfsf9P41274 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Tnfsf9P41274 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tnfsf9P41274 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tnfsf9P41274 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tnfsf9P41274 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tnfsf9P41274 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tnfsf9P41274 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tnfsf9P41274 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Tnfsf9P41274 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Tnfsf9P41274 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tnfsf9P41274 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tnfsf9P41274 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tnfsf9P41274 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Tnfsf9P41274 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tnfsf9P41274 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Tnfsf9P41274 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Tnfsf9P41274 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Tnfsf9P41274 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tnfsf9P41274 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Tnfsf9P41274 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Tnfsf9P41274 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Tnfsf9P41274 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tnfsf9P41274 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Tnfsf9P41274 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Tnfsf9P41274 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tnfsf9P41274 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tnfsf9P41274 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tnfsf9P41274 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tnfsf9P41274 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tnfsf9P41274 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tnfsf9P41274 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tnfsf9P41274 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tnfsf9P41274 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tnfsf9P41274 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tnfsf9P41274 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tnfsf9P41274 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tnfsf9P41274 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tnfsf9P41274 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tnfsf9P41274 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tnfsf9P41274 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tnfsf9P41274 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tnfsf9P41274 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tnfsf9P41274 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tnfsf9P41274 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tnfsf9P41274 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tnfsf9P41274 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tnfsf9P41274 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tnfsf9P41274 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tnfsf9P41274 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tnfsf9P41274 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tnfsf9P41274 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tnfsf9P41274 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tnfsf9P41274 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Tnfsf9P41274 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Tnfsf9P41274 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tnfsf9P41274 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Tnfsf9P41274 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Tnfsf9P41274 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tnfsf9P41274 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tnfsf9P41274 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tnfsf9P41274 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tnfsf9P41274 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tnfsf9P41274 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tnfsf9P41274 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.1 ms