Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
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Mmp9P41245 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
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Mmp9P41245 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
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