Protein–RNA interactions for Protein: P35419

Tpo, Thyroid peroxidase, mousemouse

Predictions only

Length 914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TpoP35419 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TpoP35419 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TpoP35419 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TpoP35419 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TpoP35419 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TpoP35419 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TpoP35419 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TpoP35419 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TpoP35419 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TpoP35419 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TpoP35419 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TpoP35419 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TpoP35419 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TpoP35419 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TpoP35419 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
TpoP35419 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TpoP35419 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TpoP35419 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TpoP35419 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TpoP35419 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TpoP35419 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TpoP35419 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
TpoP35419 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TpoP35419 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TpoP35419 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
TpoP35419 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TpoP35419 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TpoP35419 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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TpoP35419 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TpoP35419 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
TpoP35419 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TpoP35419 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TpoP35419 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TpoP35419 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TpoP35419 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
TpoP35419 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
TpoP35419 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TpoP35419 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TpoP35419 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TpoP35419 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TpoP35419 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TpoP35419 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TpoP35419 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TpoP35419 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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TpoP35419 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TpoP35419 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TpoP35419 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
TpoP35419 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TpoP35419 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TpoP35419 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TpoP35419 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TpoP35419 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TpoP35419 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TpoP35419 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TpoP35419 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TpoP35419 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TpoP35419 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TpoP35419 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TpoP35419 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TpoP35419 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
TpoP35419 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
TpoP35419 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
TpoP35419 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
TpoP35419 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TpoP35419 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TpoP35419 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TpoP35419 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
TpoP35419 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TpoP35419 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TpoP35419 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TpoP35419 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
TpoP35419 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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TpoP35419 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TpoP35419 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
TpoP35419 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TpoP35419 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
TpoP35419 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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TpoP35419 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
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TpoP35419 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
TpoP35419 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
TpoP35419 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
TpoP35419 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TpoP35419 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TpoP35419 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
TpoP35419 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TpoP35419 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
TpoP35419 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TpoP35419 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TpoP35419 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
TpoP35419 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TpoP35419 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TpoP35419 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TpoP35419 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TpoP35419 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TpoP35419 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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