Protein–RNA interactions for Protein: P31361

Pou3f3, POU domain, class 3, transcription factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f3P31361 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pou3f3P31361 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pou3f3P31361 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pou3f3P31361 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pou3f3P31361 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pou3f3P31361 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pou3f3P31361 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pou3f3P31361 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pou3f3P31361 Gm45251-201ENSMUST00000209486 1465 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Pou3f3P31361 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pou3f3P31361 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pou3f3P31361 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pou3f3P31361 Cast-212ENSMUST00000223309 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pou3f3P31361 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pou3f3P31361 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pou3f3P31361 Kyat1-202ENSMUST00000113659 1367 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pou3f3P31361 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Pou3f3P31361 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pou3f3P31361 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pou3f3P31361 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pou3f3P31361 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pou3f3P31361 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pou3f3P31361 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pou3f3P31361 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pou3f3P31361 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pou3f3P31361 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pou3f3P31361 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pou3f3P31361 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pou3f3P31361 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pou3f3P31361 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pou3f3P31361 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pou3f3P31361 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pou3f3P31361 Gm24279-201ENSMUST00000104236 131 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pou3f3P31361 Plac8-203ENSMUST00000112910 1224 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pou3f3P31361 Saxo2-202ENSMUST00000126478 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pou3f3P31361 Gm16305-201ENSMUST00000140747 556 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pou3f3P31361 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pou3f3P31361 Gm13272-201ENSMUST00000179425 811 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pou3f3P31361 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pou3f3P31361 1700001J11Rik-201ENSMUST00000185917 759 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pou3f3P31361 Vmn1r206-201ENSMUST00000187140 1135 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pou3f3P31361 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pou3f3P31361 4933430L12Rik-201ENSMUST00000206788 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pou3f3P31361 Gm18123-201ENSMUST00000210874 822 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pou3f3P31361 Gm5907-202ENSMUST00000210969 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pou3f3P31361 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pou3f3P31361 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pou3f3P31361 Gm26670-202ENSMUST00000226862 340 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pou3f3P31361 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pou3f3P31361 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pou3f3P31361 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pou3f3P31361 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pou3f3P31361 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pou3f3P31361 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pou3f3P31361 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pou3f3P31361 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pou3f3P31361 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pou3f3P31361 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pou3f3P31361 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pou3f3P31361 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pou3f3P31361 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pou3f3P31361 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pou3f3P31361 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pou3f3P31361 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pou3f3P31361 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pou3f3P31361 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pou3f3P31361 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pou3f3P31361 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pou3f3P31361 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pou3f3P31361 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pou3f3P31361 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pou3f3P31361 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pou3f3P31361 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pou3f3P31361 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pou3f3P31361 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pou3f3P31361 Pradc1-204ENSMUST00000126805 953 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pou3f3P31361 Polr3c-205ENSMUST00000141377 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pou3f3P31361 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pou3f3P31361 Gm25830-201ENSMUST00000158923 132 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Pou3f3P31361 Gm4868-201ENSMUST00000164138 789 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Pou3f3P31361 Gm26952-201ENSMUST00000181996 409 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pou3f3P31361 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pou3f3P31361 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pou3f3P31361 Gm34379-201ENSMUST00000195036 290 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Pou3f3P31361 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pou3f3P31361 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pou3f3P31361 Cma1-202ENSMUST00000226280 1090 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pou3f3P31361 Cma1-201ENSMUST00000022834 1074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pou3f3P31361 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pou3f3P31361 Gemin6-201ENSMUST00000069486 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pou3f3P31361 Prok2-201ENSMUST00000008273 594 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pou3f3P31361 Olfr372-201ENSMUST00000093434 1016 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pou3f3P31361 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pou3f3P31361 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pou3f3P31361 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pou3f3P31361 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pou3f3P31361 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pou3f3P31361 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pou3f3P31361 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pou3f3P31361 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms