Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Gm6164-201ENSMUST00000169774 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxa2P31245 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxa2P31245 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxa2P31245 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxa2P31245 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxa2P31245 Gm18547-201ENSMUST00000192439 811 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxa2P31245 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxa2P31245 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxa2P31245 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxa2P31245 4930421C12Rik-201ENSMUST00000200814 1574 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxa2P31245 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxa2P31245 Lrrc72-201ENSMUST00000020853 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxa2P31245 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxa2P31245 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxa2P31245 Gm30853-201ENSMUST00000218367 810 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxa2P31245 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxa2P31245 Rida-201ENSMUST00000022946 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxa2P31245 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxa2P31245 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxa2P31245 4933411G06Rik-201ENSMUST00000075909 1022 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxa2P31245 Klri1-201ENSMUST00000088046 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxa2P31245 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxa2P31245 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxa2P31245 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxa2P31245 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxa2P31245 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxa2P31245 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxa2P31245 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxa2P31245 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxa2P31245 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxa2P31245 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxa2P31245 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa2P31245 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa2P31245 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa2P31245 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa2P31245 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa2P31245 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa2P31245 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa2P31245 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa2P31245 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa2P31245 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa2P31245 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa2P31245 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa2P31245 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa2P31245 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa2P31245 H2-M10.4-201ENSMUST00000057502 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa2P31245 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa2P31245 Gm13806-201ENSMUST00000117822 325 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa2P31245 Gm11411-201ENSMUST00000117951 719 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa2P31245 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa2P31245 Gm12472-201ENSMUST00000153232 1140 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa2P31245 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa2P31245 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa2P31245 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa2P31245 Gm26706-201ENSMUST00000180718 746 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa2P31245 Gm27025-201ENSMUST00000182392 942 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa2P31245 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa2P31245 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa2P31245 Gm37473-201ENSMUST00000195079 674 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa2P31245 Gm43815-201ENSMUST00000197676 990 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa2P31245 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa2P31245 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa2P31245 Gm45607-201ENSMUST00000211143 678 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa2P31245 Gm6657-204ENSMUST00000211288 1091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa2P31245 Gm7344-201ENSMUST00000212122 1222 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa2P31245 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa2P31245 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa2P31245 Gm31763-201ENSMUST00000217788 673 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa2P31245 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa2P31245 AC163354.2-201ENSMUST00000221741 649 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa2P31245 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa2P31245 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa2P31245 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa2P31245 Gm5800-201ENSMUST00000095916 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa2P31245 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa2P31245 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa2P31245 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa2P31245 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa2P31245 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa2P31245 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa2P31245 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa2P31245 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa2P31245 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa2P31245 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa2P31245 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa2P31245 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa2P31245 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa2P31245 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa2P31245 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa2P31245 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa2P31245 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa2P31245 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa2P31245 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxa2P31245 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxa2P31245 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxa2P31245 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxa2P31245 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxa2P31245 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxa2P31245 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxa2P31245 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms