Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Gm13549-201ENSMUST00000118339 796 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Gm5257-201ENSMUST00000121823 790 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Gm3318-201ENSMUST00000217604 1183 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Gm15036-201ENSMUST00000118880 400 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms