Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms