Protein–RNA interactions for Protein: P26043

Rdx, Radixin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RdxP26043 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RdxP26043 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RdxP26043 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RdxP26043 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RdxP26043 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RdxP26043 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RdxP26043 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RdxP26043 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RdxP26043 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RdxP26043 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RdxP26043 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RdxP26043 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RdxP26043 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
RdxP26043 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RdxP26043 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RdxP26043 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RdxP26043 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RdxP26043 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RdxP26043 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RdxP26043 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
RdxP26043 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RdxP26043 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RdxP26043 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RdxP26043 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RdxP26043 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RdxP26043 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RdxP26043 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RdxP26043 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RdxP26043 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RdxP26043 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RdxP26043 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RdxP26043 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RdxP26043 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
RdxP26043 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RdxP26043 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RdxP26043 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RdxP26043 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RdxP26043 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RdxP26043 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RdxP26043 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RdxP26043 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RdxP26043 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RdxP26043 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RdxP26043 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RdxP26043 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RdxP26043 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RdxP26043 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RdxP26043 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RdxP26043 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RdxP26043 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
RdxP26043 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RdxP26043 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RdxP26043 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RdxP26043 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RdxP26043 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RdxP26043 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RdxP26043 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
RdxP26043 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RdxP26043 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RdxP26043 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
RdxP26043 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RdxP26043 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RdxP26043 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RdxP26043 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RdxP26043 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RdxP26043 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RdxP26043 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RdxP26043 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RdxP26043 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RdxP26043 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RdxP26043 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RdxP26043 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RdxP26043 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RdxP26043 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RdxP26043 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RdxP26043 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RdxP26043 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RdxP26043 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RdxP26043 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RdxP26043 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RdxP26043 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RdxP26043 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RdxP26043 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RdxP26043 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RdxP26043 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RdxP26043 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RdxP26043 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RdxP26043 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RdxP26043 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
RdxP26043 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
RdxP26043 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RdxP26043 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RdxP26043 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RdxP26043 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RdxP26043 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RdxP26043 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RdxP26043 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RdxP26043 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RdxP26043 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RdxP26043 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms