Protein–RNA interactions for Protein: P23591

Tsta3, GDP-L-fucose synthase, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsta3P23591 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Tsta3P23591 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Tsta3P23591 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Tsta3P23591 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Tsta3P23591 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tsta3P23591 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Tsta3P23591 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Tsta3P23591 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tsta3P23591 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tsta3P23591 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tsta3P23591 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tsta3P23591 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tsta3P23591 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tsta3P23591 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Tsta3P23591 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Tsta3P23591 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Tsta3P23591 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Tsta3P23591 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Tsta3P23591 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tsta3P23591 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tsta3P23591 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tsta3P23591 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tsta3P23591 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tsta3P23591 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tsta3P23591 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tsta3P23591 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tsta3P23591 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tsta3P23591 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tsta3P23591 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tsta3P23591 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tsta3P23591 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tsta3P23591 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tsta3P23591 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tsta3P23591 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tsta3P23591 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tsta3P23591 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tsta3P23591 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Tsta3P23591 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tsta3P23591 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tsta3P23591 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tsta3P23591 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tsta3P23591 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tsta3P23591 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Tsta3P23591 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tsta3P23591 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tsta3P23591 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tsta3P23591 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tsta3P23591 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tsta3P23591 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Tsta3P23591 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tsta3P23591 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tsta3P23591 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tsta3P23591 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tsta3P23591 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Tsta3P23591 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tsta3P23591 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Tsta3P23591 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tsta3P23591 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tsta3P23591 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Tsta3P23591 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tsta3P23591 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Tsta3P23591 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tsta3P23591 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Tsta3P23591 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tsta3P23591 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tsta3P23591 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Tsta3P23591 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tsta3P23591 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Tsta3P23591 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tsta3P23591 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tsta3P23591 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tsta3P23591 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tsta3P23591 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tsta3P23591 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tsta3P23591 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tsta3P23591 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tsta3P23591 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Tsta3P23591 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tsta3P23591 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tsta3P23591 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tsta3P23591 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tsta3P23591 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tsta3P23591 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tsta3P23591 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tsta3P23591 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tsta3P23591 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tsta3P23591 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tsta3P23591 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tsta3P23591 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tsta3P23591 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tsta3P23591 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tsta3P23591 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tsta3P23591 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tsta3P23591 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tsta3P23591 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tsta3P23591 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Tsta3P23591 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tsta3P23591 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tsta3P23591 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tsta3P23591 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms