Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PrkchP23298 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PrkchP23298 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PrkchP23298 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PrkchP23298 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PrkchP23298 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PrkchP23298 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PrkchP23298 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PrkchP23298 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PrkchP23298 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PrkchP23298 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PrkchP23298 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PrkchP23298 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms