Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms