Protein–RNA interactions for Protein: P20181

Ntf3, Neurotrophin-3, mousemouse

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Length 258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf3P20181 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ntf3P20181 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ntf3P20181 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ntf3P20181 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ntf3P20181 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ntf3P20181 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ntf3P20181 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ntf3P20181 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ntf3P20181 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ntf3P20181 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ntf3P20181 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ntf3P20181 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ntf3P20181 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ntf3P20181 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ntf3P20181 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ntf3P20181 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ntf3P20181 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ntf3P20181 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ntf3P20181 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ntf3P20181 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ntf3P20181 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ntf3P20181 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ntf3P20181 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ntf3P20181 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ntf3P20181 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ntf3P20181 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ntf3P20181 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ntf3P20181 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ntf3P20181 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ntf3P20181 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ntf3P20181 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ntf3P20181 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ntf3P20181 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ntf3P20181 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ntf3P20181 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ntf3P20181 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ntf3P20181 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ntf3P20181 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ntf3P20181 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ntf3P20181 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ntf3P20181 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ntf3P20181 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ntf3P20181 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ntf3P20181 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ntf3P20181 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ntf3P20181 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ntf3P20181 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ntf3P20181 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ntf3P20181 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ntf3P20181 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ntf3P20181 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ntf3P20181 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ntf3P20181 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ntf3P20181 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ntf3P20181 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ntf3P20181 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ntf3P20181 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ntf3P20181 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ntf3P20181 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ntf3P20181 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ntf3P20181 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ntf3P20181 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ntf3P20181 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ntf3P20181 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ntf3P20181 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ntf3P20181 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ntf3P20181 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ntf3P20181 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ntf3P20181 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ntf3P20181 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ntf3P20181 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ntf3P20181 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ntf3P20181 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ntf3P20181 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ntf3P20181 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ntf3P20181 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ntf3P20181 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ntf3P20181 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ntf3P20181 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ntf3P20181 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ntf3P20181 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ntf3P20181 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ntf3P20181 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ntf3P20181 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ntf3P20181 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ntf3P20181 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ntf3P20181 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ntf3P20181 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ntf3P20181 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ntf3P20181 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ntf3P20181 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ntf3P20181 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ntf3P20181 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ntf3P20181 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ntf3P20181 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ntf3P20181 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ntf3P20181 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ntf3P20181 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ntf3P20181 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ntf3P20181 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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