Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
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P18530 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
P18530 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
P18530 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
P18530 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
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P18530 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
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P18530 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
P18530 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
P18530 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
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P18530 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
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P18530 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
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P18530 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
P18530 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
P18530 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
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P18530 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
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P18530 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
P18530 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
P18530 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
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P18530 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
P18530 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
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P18530 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
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P18530 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
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P18530 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
P18530 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
P18530 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
P18530 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
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P18530 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
P18530 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
P18530 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
P18530 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P18530 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P18530 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
P18530 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
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