Protein–RNA interactions for Protein: P18529

Ig heavy chain V region 5-76, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18529 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
P18529 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18529 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18529 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18529 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18529 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18529 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18529 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18529 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18529 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18529 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18529 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18529 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18529 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18529 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18529 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18529 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18529 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18529 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18529 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18529 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18529 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18529 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18529 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18529 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18529 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18529 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18529 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18529 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18529 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18529 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18529 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18529 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18529 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18529 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18529 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18529 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18529 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18529 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18529 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18529 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
P18529 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18529 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18529 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18529 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18529 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18529 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18529 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18529 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18529 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18529 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18529 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18529 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18529 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18529 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
P18529 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
P18529 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18529 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18529 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18529 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18529 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18529 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18529 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18529 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18529 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18529 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18529 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18529 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18529 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18529 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18529 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18529 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
P18529 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18529 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18529 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18529 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18529 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18529 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18529 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18529 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P18529 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18529 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18529 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18529 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18529 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18529 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18529 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18529 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18529 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18529 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P18529 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P18529 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18529 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18529 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P18529 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18529 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P18529 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P18529 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18529 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18529 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
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