Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
P18528 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
P18528 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
P18528 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
P18528 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
P18528 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
P18528 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
P18528 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
P18528 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
P18528 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
P18528 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
P18528 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
P18528 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
P18528 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
P18528 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
P18528 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
P18528 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
P18528 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
P18528 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.82□□□□□ -0.84
P18528 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
P18528 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
P18528 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
P18528 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
P18528 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
P18528 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
P18528 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
P18528 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
P18528 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
P18528 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
P18528 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
P18528 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
P18528 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
P18528 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
P18528 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
P18528 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
P18528 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
P18528 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
P18528 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
P18528 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
P18528 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
P18528 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
P18528 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
P18528 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
P18528 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
P18528 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
P18528 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
P18528 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
P18528 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
P18528 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
P18528 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
P18528 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
P18528 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
P18528 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
P18528 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
P18528 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
P18528 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
P18528 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
P18528 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
P18528 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
P18528 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
P18528 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
P18528 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
P18528 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
P18528 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
P18528 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
P18528 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
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P18528 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
P18528 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
P18528 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
P18528 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
P18528 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
P18528 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
P18528 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
P18528 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
P18528 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
P18528 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
P18528 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
P18528 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
P18528 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
P18528 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
P18528 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
P18528 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
P18528 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
P18528 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
P18528 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
P18528 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
P18528 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
P18528 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
P18528 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
P18528 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
P18528 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
P18528 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
P18528 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
P18528 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
P18528 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
P18528 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
P18528 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
P18528 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
P18528 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
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