Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Speer4f2-201ENSMUST00000166086 1278 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Gm25025-201ENSMUST00000175018 111 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Gm37629-201ENSMUST00000193635 1050 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Hoxb1P17919 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Hoxb1P17919 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Hoxb1P17919 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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