Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
RhoP15409 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
RhoP15409 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
RhoP15409 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
RhoP15409 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
RhoP15409 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
RhoP15409 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
RhoP15409 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
RhoP15409 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
RhoP15409 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
RhoP15409 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
RhoP15409 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
RhoP15409 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
RhoP15409 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
RhoP15409 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
RhoP15409 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
RhoP15409 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
RhoP15409 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
RhoP15409 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
RhoP15409 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
RhoP15409 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
RhoP15409 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
RhoP15409 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
RhoP15409 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
RhoP15409 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
RhoP15409 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
RhoP15409 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
RhoP15409 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
RhoP15409 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
RhoP15409 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
RhoP15409 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
RhoP15409 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
RhoP15409 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
RhoP15409 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
RhoP15409 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
RhoP15409 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
RhoP15409 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
RhoP15409 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
RhoP15409 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
RhoP15409 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
RhoP15409 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
RhoP15409 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
RhoP15409 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
RhoP15409 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
RhoP15409 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
RhoP15409 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
RhoP15409 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
RhoP15409 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
RhoP15409 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
RhoP15409 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
RhoP15409 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
RhoP15409 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
RhoP15409 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
RhoP15409 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
RhoP15409 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
RhoP15409 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
RhoP15409 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
RhoP15409 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
RhoP15409 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
RhoP15409 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
RhoP15409 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
RhoP15409 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
RhoP15409 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
RhoP15409 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
RhoP15409 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
RhoP15409 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
RhoP15409 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
RhoP15409 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
RhoP15409 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
RhoP15409 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
RhoP15409 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
RhoP15409 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RhoP15409 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RhoP15409 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RhoP15409 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RhoP15409 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RhoP15409 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RhoP15409 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RhoP15409 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RhoP15409 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
RhoP15409 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RhoP15409 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
RhoP15409 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
RhoP15409 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
RhoP15409 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RhoP15409 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
RhoP15409 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
RhoP15409 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
RhoP15409 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RhoP15409 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
RhoP15409 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
RhoP15409 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
RhoP15409 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
RhoP15409 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
RhoP15409 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
RhoP15409 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
RhoP15409 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
RhoP15409 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
RhoP15409 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
RhoP15409 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
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