Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Atad5-202ENSMUST00000108239 7266 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Mid1-201ENSMUST00000036753 3753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 CK137956-201ENSMUST00000030614 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Son-202ENSMUST00000114037 8399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Tor4a-201ENSMUST00000081869 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Ing3-202ENSMUST00000115389 2546 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Olfr1113-202ENSMUST00000215611 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Trak2-201ENSMUST00000027186 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Ndufb2-205ENSMUST00000135671 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Gm42571-201ENSMUST00000201197 2464 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Zkscan6-201ENSMUST00000018491 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Gm43636-201ENSMUST00000201501 2235 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms