Protein–RNA interactions for Protein: P09225

Lta, Lymphotoxin-alpha, mousemouse

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Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtaP09225 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
LtaP09225 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
LtaP09225 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
LtaP09225 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
LtaP09225 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
LtaP09225 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
LtaP09225 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LtaP09225 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LtaP09225 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LtaP09225 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LtaP09225 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LtaP09225 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LtaP09225 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LtaP09225 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
LtaP09225 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
LtaP09225 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
LtaP09225 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LtaP09225 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LtaP09225 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LtaP09225 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LtaP09225 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LtaP09225 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
LtaP09225 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LtaP09225 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LtaP09225 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LtaP09225 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
LtaP09225 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LtaP09225 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LtaP09225 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LtaP09225 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LtaP09225 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LtaP09225 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LtaP09225 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LtaP09225 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LtaP09225 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
LtaP09225 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LtaP09225 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LtaP09225 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LtaP09225 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
LtaP09225 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LtaP09225 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LtaP09225 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LtaP09225 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LtaP09225 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LtaP09225 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LtaP09225 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LtaP09225 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LtaP09225 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
LtaP09225 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LtaP09225 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LtaP09225 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LtaP09225 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
LtaP09225 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LtaP09225 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
LtaP09225 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
LtaP09225 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LtaP09225 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LtaP09225 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
LtaP09225 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
LtaP09225 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
LtaP09225 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
LtaP09225 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
LtaP09225 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LtaP09225 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LtaP09225 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LtaP09225 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
LtaP09225 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LtaP09225 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LtaP09225 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LtaP09225 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LtaP09225 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LtaP09225 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LtaP09225 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
LtaP09225 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LtaP09225 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LtaP09225 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LtaP09225 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LtaP09225 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LtaP09225 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LtaP09225 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LtaP09225 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LtaP09225 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LtaP09225 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LtaP09225 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LtaP09225 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LtaP09225 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LtaP09225 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LtaP09225 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LtaP09225 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LtaP09225 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LtaP09225 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
LtaP09225 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LtaP09225 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LtaP09225 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
LtaP09225 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
LtaP09225 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
LtaP09225 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LtaP09225 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LtaP09225 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
LtaP09225 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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