Protein–RNA interactions for Protein: P04212

T-cell receptor beta chain V region LB2, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04212 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P04212 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P04212 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P04212 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
P04212 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
P04212 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P04212 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P04212 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
P04212 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
P04212 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P04212 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P04212 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P04212 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P04212 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P04212 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P04212 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P04212 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P04212 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P04212 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P04212 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P04212 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P04212 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P04212 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P04212 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P04212 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P04212 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P04212 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P04212 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P04212 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P04212 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P04212 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
P04212 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P04212 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P04212 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P04212 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P04212 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P04212 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P04212 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P04212 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P04212 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P04212 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P04212 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P04212 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P04212 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P04212 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P04212 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P04212 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P04212 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P04212 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P04212 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P04212 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P04212 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P04212 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P04212 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P04212 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P04212 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P04212 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P04212 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P04212 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P04212 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
P04212 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
P04212 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P04212 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
P04212 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P04212 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC10□□□□□ -0.81
P04212 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P04212 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P04212 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P04212 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P04212 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P04212 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P04212 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P04212 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P04212 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P04212 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC10□□□□□ -0.81
P04212 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P04212 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P04212 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P04212 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P04212 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P04212 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P04212 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC10□□□□□ -0.81
P04212 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P04212 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P04212 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P04212 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P04212 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P04212 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
P04212 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P04212 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P04212 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P04212 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC10□□□□□ -0.81
P04212 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P04212 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P04212 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC10□□□□□ -0.81
P04212 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC10□□□□□ -0.81
P04212 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC10□□□□□ -0.81
P04212 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
P04212 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P04212 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms