Protein–RNA interactions for Protein: P01660

Ig kappa chain V-III region PC 3741/TEPC 111, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01660 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01660 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P01660 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01660 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P01660 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01660 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01660 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01660 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01660 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01660 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01660 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01660 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P01660 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P01660 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01660 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01660 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P01660 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P01660 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P01660 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01660 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01660 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01660 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01660 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01660 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01660 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01660 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01660 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01660 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01660 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01660 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01660 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01660 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01660 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01660 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01660 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01660 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01660 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01660 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01660 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01660 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01660 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01660 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P01660 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01660 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01660 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01660 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01660 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01660 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P01660 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01660 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01660 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01660 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01660 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01660 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01660 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P01660 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P01660 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01660 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01660 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01660 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01660 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01660 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01660 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01660 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01660 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01660 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01660 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01660 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01660 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01660 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01660 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P01660 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P01660 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P01660 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01660 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01660 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P01660 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P01660 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P01660 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01660 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P01660 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P01660 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01660 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01660 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01660 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01660 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01660 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01660 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01660 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01660 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01660 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01660 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01660 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01660 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P01660 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01660 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01660 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01660 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01660 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01660 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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