Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Ccl20O89093 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Ccl20O89093 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Ccl20O89093 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Ccl20O89093 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Ccl20O89093 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Ccl20O89093 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Ccl20O89093 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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