Protein–RNA interactions for Protein: O54941

Smarce1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarce1O54941 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Smarce1O54941 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Smarce1O54941 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smarce1O54941 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smarce1O54941 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Smarce1O54941 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smarce1O54941 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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