Protein–RNA interactions for Protein: O54693

Eda, Ectodysplasin-A, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EdaO54693 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
EdaO54693 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
EdaO54693 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
EdaO54693 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
EdaO54693 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
EdaO54693 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
EdaO54693 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
EdaO54693 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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EdaO54693 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
EdaO54693 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
EdaO54693 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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EdaO54693 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
EdaO54693 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
EdaO54693 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
EdaO54693 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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EdaO54693 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
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EdaO54693 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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EdaO54693 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
EdaO54693 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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EdaO54693 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
EdaO54693 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
EdaO54693 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
EdaO54693 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
EdaO54693 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
EdaO54693 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
EdaO54693 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
EdaO54693 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
EdaO54693 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
EdaO54693 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
EdaO54693 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
EdaO54693 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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EdaO54693 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
EdaO54693 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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EdaO54693 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
EdaO54693 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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EdaO54693 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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EdaO54693 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
EdaO54693 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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EdaO54693 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
EdaO54693 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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EdaO54693 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
EdaO54693 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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EdaO54693 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
EdaO54693 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
EdaO54693 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
EdaO54693 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
EdaO54693 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
EdaO54693 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
EdaO54693 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
EdaO54693 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
EdaO54693 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
EdaO54693 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
EdaO54693 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
EdaO54693 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
EdaO54693 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
EdaO54693 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
EdaO54693 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
EdaO54693 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
EdaO54693 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
EdaO54693 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
EdaO54693 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
EdaO54693 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
EdaO54693 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
EdaO54693 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms