Protein–RNA interactions for Protein: O35740

Cited2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited2O35740 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cited2O35740 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cited2O35740 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Celf3-215ENSMUST00000200342 3173 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Casc1-208ENSMUST00000204105 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Nufip2-204ENSMUST00000181023 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Olfr1090-202ENSMUST00000215991 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cited2O35740 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cited2O35740 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cited2O35740 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Cited2O35740 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms