Protein–RNA interactions for Protein: O35347

Dgcr6, Protein DGCR6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dgcr6O35347 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Dgcr6O35347 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Dgcr6O35347 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Dgcr6O35347 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Dgcr6O35347 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Dgcr6O35347 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Dgcr6O35347 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Dgcr6O35347 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Dgcr6O35347 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Dgcr6O35347 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Dgcr6O35347 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Dgcr6O35347 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Dgcr6O35347 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Dgcr6O35347 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Dgcr6O35347 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Dgcr6O35347 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Dgcr6O35347 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Dgcr6O35347 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Dgcr6O35347 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Dgcr6O35347 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Dgcr6O35347 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Dgcr6O35347 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Dgcr6O35347 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Dgcr6O35347 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Dgcr6O35347 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Dgcr6O35347 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Dgcr6O35347 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Dgcr6O35347 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Dgcr6O35347 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Dgcr6O35347 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Dgcr6O35347 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Dgcr6O35347 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Dgcr6O35347 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Dgcr6O35347 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Dgcr6O35347 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Dgcr6O35347 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Dgcr6O35347 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Dgcr6O35347 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Dgcr6O35347 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Dgcr6O35347 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Dgcr6O35347 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Dgcr6O35347 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Dgcr6O35347 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Dgcr6O35347 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Dgcr6O35347 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Dgcr6O35347 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Dgcr6O35347 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Dgcr6O35347 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Dgcr6O35347 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Dgcr6O35347 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Dgcr6O35347 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Dgcr6O35347 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Dgcr6O35347 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Dgcr6O35347 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Dgcr6O35347 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Dgcr6O35347 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Dgcr6O35347 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Dgcr6O35347 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Dgcr6O35347 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Dgcr6O35347 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Dgcr6O35347 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Dgcr6O35347 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Dgcr6O35347 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Dgcr6O35347 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Dgcr6O35347 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Dgcr6O35347 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Dgcr6O35347 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Dgcr6O35347 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Dgcr6O35347 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Dgcr6O35347 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Dgcr6O35347 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Dgcr6O35347 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Dgcr6O35347 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Dgcr6O35347 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Dgcr6O35347 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Dgcr6O35347 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Dgcr6O35347 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
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Dgcr6O35347 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Dgcr6O35347 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Dgcr6O35347 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
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