Protein–RNA interactions for Protein: O35111

Kcnk3, Potassium channel subfamily K member 3, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnk3O35111 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Apc-203ENSMUST00000115781 12346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Gm30648-202ENSMUST00000200648 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
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Kcnk3O35111 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Myh9-201ENSMUST00000016771 7433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
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Kcnk3O35111 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms