Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Casq1O09165 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Casq1O09165 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Casq1O09165 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Casq1O09165 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Casq1O09165 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Casq1O09165 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Casq1O09165 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Casq1O09165 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Casq1O09165 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Casq1O09165 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Casq1O09165 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Casq1O09165 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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