Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

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Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
MttpO08601 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
MttpO08601 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
MttpO08601 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
MttpO08601 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
MttpO08601 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
MttpO08601 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
MttpO08601 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
MttpO08601 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
MttpO08601 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
MttpO08601 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
MttpO08601 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
MttpO08601 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
MttpO08601 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
MttpO08601 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
MttpO08601 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
MttpO08601 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
MttpO08601 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
MttpO08601 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
MttpO08601 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
MttpO08601 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
MttpO08601 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
MttpO08601 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
MttpO08601 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
MttpO08601 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
MttpO08601 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
MttpO08601 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
MttpO08601 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
MttpO08601 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
MttpO08601 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
MttpO08601 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
MttpO08601 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
MttpO08601 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
MttpO08601 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
MttpO08601 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
MttpO08601 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
MttpO08601 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
MttpO08601 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
MttpO08601 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
MttpO08601 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
MttpO08601 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
MttpO08601 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
MttpO08601 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
MttpO08601 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
MttpO08601 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
MttpO08601 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
MttpO08601 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
MttpO08601 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
MttpO08601 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
MttpO08601 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
MttpO08601 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
MttpO08601 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
MttpO08601 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
MttpO08601 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
MttpO08601 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
MttpO08601 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
MttpO08601 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
MttpO08601 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
MttpO08601 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
MttpO08601 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
MttpO08601 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
MttpO08601 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
MttpO08601 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
MttpO08601 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
MttpO08601 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
MttpO08601 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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MttpO08601 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
MttpO08601 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
MttpO08601 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
MttpO08601 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
MttpO08601 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
MttpO08601 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
MttpO08601 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
MttpO08601 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
MttpO08601 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
MttpO08601 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
MttpO08601 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
MttpO08601 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
MttpO08601 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
MttpO08601 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
MttpO08601 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
MttpO08601 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
MttpO08601 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
MttpO08601 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
MttpO08601 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
MttpO08601 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
MttpO08601 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
MttpO08601 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
MttpO08601 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
MttpO08601 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
MttpO08601 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
MttpO08601 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
MttpO08601 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
MttpO08601 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
MttpO08601 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
MttpO08601 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
MttpO08601 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
MttpO08601 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
MttpO08601 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms