Protein–RNA interactions for Protein: J3QPE5

Gm5849, Predicted gene 5849, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5849J3QPE5 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Abca3-203ENSMUST00000117337 5202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Myo5a-201ENSMUST00000123128 11702 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Gm3294-201ENSMUST00000164104 7367 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Ahrr-201ENSMUST00000022059 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Pnpla3-201ENSMUST00000045289 4640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Acot11-202ENSMUST00000102762 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 2210010C04Rik-201ENSMUST00000031931 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Ppp4r1l-ps-202ENSMUST00000132669 2767 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 2410004P03Rik-201ENSMUST00000095823 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Zfp775-201ENSMUST00000061720 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Rxfp2-201ENSMUST00000065745 2539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 5430419D17Rik-203ENSMUST00000208921 7948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Meox2-201ENSMUST00000041183 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Nek4-203ENSMUST00000226551 4098 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Limch1-202ENSMUST00000101164 5192 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Robo4-203ENSMUST00000115048 3392 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Ptpn21-202ENSMUST00000170188 5562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Olfr464-205ENSMUST00000217112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Rassf9-202ENSMUST00000219445 5294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Oprm1-230ENSMUST00000154906 2039 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Ankrd11-202ENSMUST00000098334 8455 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Zfp280d-211ENSMUST00000184036 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms