Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Olfr1121-202ENSMUST00000213792 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Ccdc136-208ENSMUST00000180829 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Usp11-201ENSMUST00000033383 3467 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Il10ra-202ENSMUST00000176222 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Slco5a1-201ENSMUST00000115402 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Nucks1-201ENSMUST00000062264 5998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Zfp354b-201ENSMUST00000109124 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Rims2-204ENSMUST00000226410 3685 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Kcnj9-201ENSMUST00000062387 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 P2ry1-202ENSMUST00000193201 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 AC160340.2-201ENSMUST00000220812 3675 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Ocstamp-201ENSMUST00000029213 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms