Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC9.9□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms