Protein–RNA interactions for Protein: F6ZED4

Gm9970, Predicted gene 9970, mousemouse

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Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9970F6ZED4 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Gm9970F6ZED4 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Gm9970F6ZED4 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9970F6ZED4 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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