Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms