Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

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Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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