Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Myo5cE9Q1F5 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Myo5cE9Q1F5 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Myo5cE9Q1F5 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Myo5cE9Q1F5 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Myo5cE9Q1F5 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Myo5cE9Q1F5 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Myo5cE9Q1F5 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Myo5cE9Q1F5 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Myo5cE9Q1F5 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Myo5cE9Q1F5 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Myo5cE9Q1F5 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Myo5cE9Q1F5 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Myo5cE9Q1F5 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Myo5cE9Q1F5 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Myo5cE9Q1F5 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Myo5cE9Q1F5 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Myo5cE9Q1F5 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Myo5cE9Q1F5 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Myo5cE9Q1F5 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Myo5cE9Q1F5 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Myo5cE9Q1F5 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Myo5cE9Q1F5 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Myo5cE9Q1F5 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Myo5cE9Q1F5 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Myo5cE9Q1F5 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Myo5cE9Q1F5 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Myo5cE9Q1F5 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Myo5cE9Q1F5 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Myo5cE9Q1F5 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Myo5cE9Q1F5 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Myo5cE9Q1F5 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Myo5cE9Q1F5 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Myo5cE9Q1F5 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Myo5cE9Q1F5 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Myo5cE9Q1F5 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Myo5cE9Q1F5 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Myo5cE9Q1F5 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Myo5cE9Q1F5 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Myo5cE9Q1F5 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Myo5cE9Q1F5 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Myo5cE9Q1F5 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Myo5cE9Q1F5 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Myo5cE9Q1F5 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Myo5cE9Q1F5 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Myo5cE9Q1F5 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Myo5cE9Q1F5 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Myo5cE9Q1F5 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Myo5cE9Q1F5 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Myo5cE9Q1F5 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Myo5cE9Q1F5 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Myo5cE9Q1F5 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Myo5cE9Q1F5 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Myo5cE9Q1F5 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Myo5cE9Q1F5 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Myo5cE9Q1F5 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Myo5cE9Q1F5 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Myo5cE9Q1F5 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Myo5cE9Q1F5 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Myo5cE9Q1F5 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Myo5cE9Q1F5 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Myo5cE9Q1F5 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Myo5cE9Q1F5 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Myo5cE9Q1F5 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Myo5cE9Q1F5 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Myo5cE9Q1F5 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Myo5cE9Q1F5 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Myo5cE9Q1F5 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Myo5cE9Q1F5 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Myo5cE9Q1F5 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Myo5cE9Q1F5 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Myo5cE9Q1F5 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Myo5cE9Q1F5 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Myo5cE9Q1F5 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Myo5cE9Q1F5 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Myo5cE9Q1F5 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Myo5cE9Q1F5 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Myo5cE9Q1F5 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Myo5cE9Q1F5 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Myo5cE9Q1F5 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Myo5cE9Q1F5 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Myo5cE9Q1F5 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Myo5cE9Q1F5 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Myo5cE9Q1F5 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Myo5cE9Q1F5 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Myo5cE9Q1F5 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Myo5cE9Q1F5 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Myo5cE9Q1F5 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms