Protein–RNA interactions for Protein: E9Q166

Atad2b, ATPase family, AAA domain-containing 2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,460 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atad2bE9Q166 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Atad2bE9Q166 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Atad2bE9Q166 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Atad2bE9Q166 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Atad2bE9Q166 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atad2bE9Q166 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Atad2bE9Q166 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atad2bE9Q166 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atad2bE9Q166 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atad2bE9Q166 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atad2bE9Q166 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atad2bE9Q166 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atad2bE9Q166 Cdk5-203ENSMUST00000198990 783 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atad2bE9Q166 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atad2bE9Q166 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atad2bE9Q166 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atad2bE9Q166 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atad2bE9Q166 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Atad2bE9Q166 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atad2bE9Q166 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atad2bE9Q166 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atad2bE9Q166 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atad2bE9Q166 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Atad2bE9Q166 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Atad2bE9Q166 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Atad2bE9Q166 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Atad2bE9Q166 Pex5l-203ENSMUST00000108221 1187 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 Mid1-ps1-201ENSMUST00000167967 1248 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 Pigx-212ENSMUST00000215073 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 4631405J19Rik-201ENSMUST00000099699 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 Gm4868-201ENSMUST00000164138 789 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 Gm37207-201ENSMUST00000194284 296 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 Tmprss11c-202ENSMUST00000196462 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 Gm18010-201ENSMUST00000203553 202 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 Gm31557-202ENSMUST00000213995 722 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 Gm42432-201ENSMUST00000197902 1617 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 Grk3-204ENSMUST00000197888 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 Gm13827-201ENSMUST00000148801 372 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 Lsm8-204ENSMUST00000201141 503 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 Prr19-201ENSMUST00000080288 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 Nifk-202ENSMUST00000112688 849 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 Gm5395-201ENSMUST00000121650 915 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 Bola3-203ENSMUST00000122216 554 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 Gm15886-201ENSMUST00000123155 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 Tspan32os-201ENSMUST00000131740 975 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 Lsm3-201ENSMUST00000040607 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.8 ms